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Dr. Armando Hernández Mendoza

Profesor-Investigador
Laboratorio de Bioinformática y Genómica Evolutiva
Categoría: Titular B - SNI: Nivel I
Formación académica:
Licenciatura en Biología. Universidad Veracruzana. 1992.
Maestría en Biotecnología. Instituto de Biotecnología, UNAM. 1999.
Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Instituto de Biotecnología, UNAM. 2006.
Posdoctorado en Instituto de Biotecnología, UNAM.
Email: ahm@uaem.mx
Tel: +52 (777) 3297000 ext. 3687
+52 (777)3297020

           

  1. Análisis bioinformáticos de secuenciación masiva de DNA y RNA en diversos organismos modelo.
  2. Ensamblado, anotación y comparación de  genomas bacterianos.
  1. Hernández-Mendoza A, Salgado-Morales R, Morán-Vázquez A, López-Torres D, García-Gómez BI, Dantán-González E. 2022. Molecular Characterization of pBOq-IncQ and pBOq-95LK Plasmids of Escherichia coli BOq 01, a New Isolated Strain from Poultry Farming, Involved in Antibiotic Resistance. Microorganisms. 10(8):1509. doi: 10.3390/microorganisms10081509.
  2. Marbán-González A, Hernández-Mendoza A, Ordóñez M, Razo-Hernández RS, Viveros-Ceballos JL. 2021. Discovery of Octahydroisoindolone as a Scaffold for the Selective Inhibition of Chitinase B1 from Aspergillus fumigatus: In Silico Drug Design Studies. Molecules. 26(24):7606. doi: 10.3390/molecules26247606.
  3. Vichi J, Salazar E, Jacinto VJ, Rodriguez LO, Grande R, Dantán-González E, Morett E, Hernández-Mendoza A. 2021. High-throughput transcriptome sequencing and comparative analysis of Escherichia coli and Schizosaccharomyces pombe in respiratory and fermentative growth. PLoS One. 16(3):e0248513.
  4. Elufisan TO, Rodríguez-Luna IC, Oyedara OO, Sánchez-Varela A, Hernández-Mendoza A, Dantán Gonzalez E, Paz-González AD, Muhammad K, Rivera G, Villalobos-Lopez MA, Guo X. 2020. The Polycyclic Aromatic Hydrocarbon (PAH) degradation activities and genome analysis of a novel strain Stenotrophomonas sp. Pemsol isolated from Mexico. PeerJ.
  5. Dávila-Ramos Sonia, Castelán-Sánchez Hugo G., Martínez-Ávila Liliana, Sánchez-Carbente María del Rayo, Peralta Raúl, Hernández-Mendoza Armando, Dobson Alan D.W., González Ramón A., Pastor Nina, Batista-García Ramón Alberto. 2019. A Review on Viral Metagenomics in Extreme Environments.  Frontiers in Microbiology. 10:2403.
  6. Elufisan Temidayo O, Rodríguez-Luna Isabel C., Oyedara Omotayo O., Sánchez-Varela Alejandro, Hernández Mendoza Armando, Danran Gonzalez Edgar, Paz-González Alma D., Muhammad Kashif, Rivera Gildardo, Villalobos-López Miguel A., Guo Xianwu. 2019. Stenotrophomonas sp. Pemsol isolated from crude oil contaminated soil in Mexico that can degrade polycyclic aromatic hydrocarbons and its whole genome sequence analyzed. PeerJ Preprints 7:e27617v1.
  7. Hernández-Mendoza Armando, Rivera Mendoza Daniel, Moran-Vazquez Abimael, Dantán-González Edgar. 2018. Draft Genome Sequences and Complete Sequences of Two Plasmids of Escherichia coli Strain BOq 01, a Multiple-Antibiotic-Resistant Strain Isolated from a Poultry Farm in Mexico. Microbiol Resour Announc. Nov; 7(20): e01104-18.
  8. Salgado-Morales Rosalba, Rivera-Gómez Nancy, Lozano-Aguirre Beltrán Luis Fernando, Hernández-Mendoza Armando, Dantán-González Edgar. 2017. Draft Genome Sequence of a Pseudomonas aeruginosa NA04 Bacterium Isolated from an Entomopathogenic Nematode. Genome Announc. Sep; 5(36): e00746-17.
  9. Salgado-Morales Rosalba, Rivera-Gómez Nancy, Martínez-Ocampo Fernando, Lozano-Aguirre Beltrán Luis Fernando, Hernández-Mendoza Armando, Dantán-González Edgar. 2017. Draft Genome Sequence of Photorhabdus luminescens HIM3 Isolated from an Entomopathogenic Nematode in Agricultural Soils. Genome Announc. Aug; 5(35): e00745-17.
  10. Galindo-Albarrán Ariel O., López-Portales Óscar H., Gutiérrez-Reyna Darely Y., Rodríguez-Jorge Otoniel, Sánchez Villanueva José Antonio, Ramírez-Pliego Oscar, Bergon Aurélie, Loriod Béatrice, Holota Hélène, Imbert Jean, Hernández-Mendoza Armando, Ferrier Pierre, Carrillo-de Santa Pau Enrique, Valencia Alfonso, Spicuglia Salvatore, Santana M.Angélica. 2016. CD8+ T Cells from Human Neonates Are Biased toward an Innate Immune Response. Cell Reports 17, 2151–2160.
  11. Hidalgo Paloma, Anzures Lourdes, Hernández-Mendoza Armando, Guerrero Adán, Wood Christopher, Valdés Margarita, Dobner Thomas, González Ramón A. 2016. Morphological, Biochemical, and Functional Study of Viral Replication Compartments Isolated from Adenovirus-Infected Cells. J Virol. Apr 1; 90(7): 3411–3427.
  12. Martínez-Ocampo Fernando, Lozano-Aguirre Beltrán Luis Fernando, Hernández-Mendoza Armando, Rojas-Espinoza Luis Enrique, Popoca-Ursino Elida Carolina, Ortíz-Hernández Laura, Sánchez-Salinas Enrique, Ramos Quintana Fernando, Dantán-González Edgar. 2015. Burkholderia cenocepacia Strain CEIB S5-1, a Rhizosphere-Inhabiting Bacterium with Potential in Bioremediation Genome Announc. Mar 5;3(2). pii: e00056-15.
  13. García-Segura Laura, Abreu-Goodger Cei, Hernández-Mendoza Armando, Dimitrova Dinkova Tzvetanka D., Padilla-Noriega Luis, Pérez-Andrade Martha Elva, Miranda-Ríos Juan. 2015. High-Throughput Profiling of Caenorhabditis elegans Starvation-Responsive microRNAs. . PLoS ONE 10 (11): e0142262.
  14. Quiroz-Castañeda Rosa Estela, Mendoza-Mejía Ared, Obregón-Barboza Verónica, Martínez-Ocampo Fernando, Hernández-Mendoza Armando, Martínez-Garduño Felipe, Guillén-Solís Gabriel, Sánchez-Rodríguez Federico, Peña Chora Guadalupe, Ortiz-Hernández Laura, Gaytán-Colín Paul, Dantán-González Edgar. 2015. Identification of a New Alcaligenes faecalis Strain MOR02 and Assessment of Its Toxicity and Pathogenicity to Insects. BioMed Research International. Volume 2015, Article ID 570243, 10 pages.
  15. Hernández-Mendoza Armando, Lozano-Aguirre Beltrán Luis Fernando, Martínez-Ocampo Fernando, Quiroz-Castañeda Rosa Estela, Dantán-González Edgar. 2014. A Newly Sequenced Alcaligenes faecalis Strain: Implications for Novel Temporal Symbiotic Relationships. Genome Announc. Nov-Dec; 2(6): e01246-14.
  16. Hernández-Mendoza Armando, Martínez-Ocampo Fernando, Lozano-Aguirre Beltrán Luis Fernando, Popoca-Ursino Elida Carolina, Ortiz-Hernández Laura, Sánchez-Salinas Enrique, Dantán-González Edgar. 2014. Draft Genome Sequence of the Organophosphorus Compound Degrading Burkholderia zhejiangensis Strain CEIB S4-3. Genome Announc. Dec 18; 2(6). pii: e01323-14.
  1. 2001; EARLY RESPONSES IN THE Rhizobium LEGUME INTERACTIONS, CIFN XX ANNIVERSARY, EDITORIAL UNAM, Vol. 1, Pags. 3, C. Quinto, L. Cárdenas, D. Balleza, F. Gómez, N. Nava, E. Alemán, A. Hernández, S. Napsucialy, O. Santana.
  2. 2001; ANALYZING THE FUNCTION OF TWO nodT GENES IN Rhizobium etli. ARE THESE COPIES DIRECTLY INVOLVED IN THE NODULATION PROCESS?, Nitrogen Fixation. Global Perspectives T.M. FINAN, M.R. O’BRIAN, D.B. LAYZELL, J.K. VESSEY AND W. N, MCMASTER UNIVERSITY PRESS, Vol. 1, Pags. 1, A. Hernández-Mendoza, T. Scheublin, N. Nava, O. Santana, C. Quinto.
  1. Armando Hernández Mendoza, Fernando Martínez Ocampo. La genómica ambiental, centinela del hábitat. Revista Hypathia Vol 56,  No.1, 2017. pp: 16-17. ISSN: 2007-4735.
  2. Edgar Dantán González, Joivier Vichi Lozada, Armando Hernández Mendoza. La revolución de la secuenciación masiva de RNA (RNA-Seq). Revista electrónica QUIU. 2017.
Licenciatura:
  1. Jessica García Flores. Identificación de lncRNAs en Escherichia coli expresados diferencialmente en presencia de glucosa o glicerol/acetato. En proceso.
  2. Abraham Gómez Trujillo. Ensamblado y anotación funcional de una cepa de Meyerozyma guilliermondii con actividad anticoccidial. Licenciatura en Ciencias (Bioquímica y Biología Molecular). En proceso.
  3. Karla Mariana Martínez Rodríguez. Identificación de ncRNAs en Schizosaccharomyces pombe expresados diferencialmente en presencia de glucosa o glicerol/acetato. Licenciatura en Ciencias (Bioquímica y Biología Molecular). 2023.
  4. Luz Ibet Rebollar Uriostegui. Análisis de la expresión de genes ortólogos en especies eucariontes sometidas a condiciones de restricción calórica.  Licenciatura en Ciencias (Bioquímica y Biología Molecular). 2023.
  5. Rebeca Martínez González. Evolución de la regulación de la expresión genética en respuesta a restricción calórica y resveratrol. Licenciatura en Ciencias (Bioquímica y Biología Molecular), UAEM. 2016.
Maestría:
  1. Priscilla Mercado Salgado. Conservación de redes de interacción biológicas en respuesta a la restricción calórica y resveratrol en modelos eucariontes y humanos. Maestría en Medicina Molecular-Facultad de Medicina, UAEM. 2017.
  2. Fernando Martínez Ocampo. Ensamblaje del genoma de Burkholderia zhejiangensis CEIB S4-3 y análisis de la anotación funcional de genes involucrados en la degradación de compuestos organofosforados. Maestría en Biotecnología-CEIB, UAEM.  2015.
Doctorado:
  1. Joivier Vichi Lozada. Análisis comparativo del transcriptoma de Escherichia coli y Schizosacchromyces pombe en dos escenarios metabólicos. Doctorado en Ciencias, UAEM.  2023.

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